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modfitLT-BD周期分析软件介绍

论文服务工具 | 2019/09/24 17:03:57  | 604 次浏览

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  运用ModFitLT进行手动分析

  如ModFitLT在自动分析过程中无法正确确定峰值的位置或样本的倍型,或者你希望自己选择分析的模式,那么你可以用手动分析来实现。

  在工具栏中点击File,选定所要分析的数据文件,单击Open。

  选择用于DNA分析的参数:FL2-A。

  设门。软件最多允许同时设两个门,点击Gate1或2前的小方框,然后单击Define。

  theGate,选择合适的X轴和Y轴,将门移动到所要分析的细胞群上,单击OK。

  单击工具栏中的Mod键或选择Analysis菜单中的ChooseModel。

  在这个对话窗口中需要你来描述你所得到的样本的信息,比如说,样本的类型,有无异倍体等。每一个有关的资料都会影响到最终分析模式的选择。

  选择碎片拟合的模式:新鲜/冻存,石蜡切片,没有碎片(不进行碎片分析);选择倍型:异倍体,二倍体,四倍体;若有异倍体,则须确定是一个还是两个异倍体;选择细胞聚集体分析模式:有聚集体,没有聚集体,或自动检测(软件自行判断有无需要拟合聚集体);选择是否拟合二倍体的S期:如异倍体的G0/G1期峰与二倍体G0/G1期峰明显分开,我们对每一个细胞周期的S期都能够进行拟合,则选择FitDiploidS;如异倍体的G0/G1期峰与二倍体G0/G1期峰靠得非常近,则选择NoDiploidS;选择能否看得见明显的G2/M期峰:VisibleG2/M,IndistinModFitLT细胞周期的分析软件_文库下载https://www.wenkuxiazai.com/doc/eeefb2aa33687e21ae45a988.htmlctG2/M(软件将自动把G2/M期峰的位置固定在两倍于G0/G1期峰的位置;选择是否拟合凋亡:FitApoptosis,NoApoptosis;选择有无标准参照物:NoStandards,OneStandard,TwoStandards;根据这些资料,软件选择分析的模式并将其显示在对话窗的下部;单击OK确认并关掉对话窗。

  软件打开分析模式,确认每个峰所在的位置,并将Range放置于不同的峰上如若软件对于各个峰的确认不太正确,你需要移动Range,将其放在正确的位置:

  将E1Range放置在碎片峰的起始;确认D1Range是否在二倍体的G0/G1期峰上,这个Range不一定将整个峰都包括在内,只要在峰的中心位置即可;

  移动A1Range将其放置在异倍体G0/G1峰的中心位置;移动D2Range将其放置于二倍体G2/M期峰的中心位置或是两倍于G0/G1期峰的位置;移动A2Range将其放置两倍于异倍体G0/G1峰的道数,即异倍体G2/M期的位置;═>若T1Range出现,你可以不去移动它的位置,它只是用来激活软件分析聚集体的功能;最后,需要将E2Range放在这个直方图的最右边,用来识别碎片的终止位置;这样,各个Range都各就各位了,可以开始进行分析了。

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