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CellNetAnalyzer是一个典型的代谢流分析工具(尽管可能也有其他的用处),可以进行代谢流的计算,预测,目标函数的优化,以及端途径分析,元素模式分析,以及代谢流之间的对比等。可以基本满足研究一个中型代谢网络的结构尤其是计算流分配的要求。
CellNetAnalyzer使用说明
则会出现找不到specie的错误。我昨天也在这个地方费了好大功夫才搞明白。3反应编辑时要加入关联的文本框,你点击Getx/ypos会出现一个选择十字线,你点击什么地方,她就在那个地方给你添加一个文本框,以后在这个文本框中的数据都是和这个反应关联的。构建完成后保存,我们的基础工作就OK了。
关于网络的构建,你也可以利用它里面的示例模板,然后修改,但是估计实际应用性可能不大。
(2)网络的软件分析
运行我们的构建网络工程,然后给随便我们的网络输入一些数据(在文本框中),同样是点击CellNetAnalyzer,在下拉框中随便选择某个函数你试着用一下,就明白了。
软件的运行:
在matlab窗口中的“startup”或者”startcna”就启动软件了,就OK了。(如果出现找不到函数或变量的错误,就是你的CellNetAnalyzer目录的问题,改变或者切换一下目录就好了)
软件的使用:
软件使用的前期工作---网络的构建是有一点麻烦的,不过依旧很容易,这或许也是使用任何一个软件不可避免的工作。当然,里面刚进去就有好多网络工程“project”的示例,你可以start一个简单的网络模型,摸索一下各个功能。
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