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北京林业大学林木分子育种创新团队在全球率先开展植物假基因的发现与功能解析,研究成果近期在线发表于生物学top期刊(5年if:).该研究为解析植物基因组复杂非编码序列功能提供了重要理论指导和技术支持.
基因组中2%的DNA用来编码蛋白质,剩余98%的序列通常被认为是物种基因组进化过程中产生的无功能"垃圾DNA(Junk DNA)'.其中,假基因是最典型的"垃圾 DNA',在林木及其他植物基因组中占较大比例.
假基因真的没有功能吗?围绕这个问题,团队开发了一套适合搜索植物基因组假基因序列的编程软件(PlantPseudo),鉴定了重要模式树种杨树等7个植物基因组的假基因序列.在杨树基因组中共鉴定出万条假基因,约是真基因数目的一半,其他植物同样如此.将假基因与基因组的调控序列比对发现,基因组很大比例的调控序列集中在假基因周围.这表明假基因并不是无用序列,它们在基因组中具有调控功能,起到了维持植物细胞正常新陈代谢的作用.
该研究得到国家重点研发计划课题与国家自然科学基金项目等项目联合支持.生物学院副教授谢剑波为文章第一作者,张德强教授为通讯作者,青年教师刘小敏,博士生李英/赵怡阳,团队成员李百炼教授与瑞典植物科学研究中心Par Ingvarsson教授参与了研究的具体实验与文章修订工作.
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