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艾德思:以一作身份在顶级期刊发表论文是怎样一种体验

论文润色 | 2019/06/27 11:38:38  | 273 次浏览

 比如,生命科学领域的CNS正刊.希望可以分享您从选题,到设计,到实验,到投稿,到修改等等,各种心得体会,万分感谢! 看到大家踊跃分享,在此表示感谢

可以来回答一波,体验写在后面.先写一些,之后会做修改和补充

最近我们研究非厄米系统的拓扑能带理论的两篇论文,在Physical Review Letters(以下简记为PRL) 发表,其中Edge states and topological invariants of Non-Hermitian Systems一文获得编辑推荐.在这一系列论文中,我们引入了non-bloch topological invariants,他准确的给出了非厄米体系拓扑相变的位置,是非厄米系统bulk-edge correspondence的忠实描述.

这篇论文获得编辑推荐,由于版权问题,只能截图PRL的网页图片 更新:上一版是接受页面,最近没顾上更新,半个月前已正式发表 首先,我想先澄清一个问题,论文所在期刊,和论文本身的质量,没有任何的必然联系,好的期刊上也有垃圾论文,一般的期刊上也有非常好的论文.我就很喜欢PRB,但是PRB的IF只有3.多,但这并不妨碍很多经典paper,比如Laughlin当年的gauge invariant argument on quantum hall effect, 比如后来Xiao-Liang Qi和Liang Fu关于TI的一系列paper,都在PRB上.期刊的好与坏,丝毫不能改变论文本身的价值,我觉得做科研,还是要为了真正干净美妙的结果而做,为了切实的新的理解而做,不能为了发个好期刊就灌水.

但另一方面,对于自己的得意之作,能够被大家眼中的好期刊接受也是很高兴的,这就好比自己一手带大的孩子,能够获得大家的赏识,是很开心的.但是另一方面,如果论文没有被接受,其实也没什么,因为最了解工作的是作者本人,对于作者而言,最重要的是自己内心满意,其实内心对这篇论文满意了,发在哪里不过是个小插曲罢了.

 

虽然题目要讲讲做的过程和投稿的体会,但是这个似乎每个人每篇论文都会不一样,不知道写出来有没有价值,如果有需要以后再添加.不过我想说的是,在科研过程中最美妙的时候,应该就是自己遇到一个问题,百思不得其解,一边内心挣扎一般尝试各种手段去解决,但是最后得到一个新的理解,一个干净/简洁/美妙的理解,那一瞬间的感觉真是柳暗花明又一村,我觉得那一刻才真正是对研究人员最大的报酬.

 

最后感谢高等研究院汪忠老师一直以来的培养以及博士生宋飞的合作,我们的论文可以在arxiv免费下载(PRL需要教育网,否则是要买的),链接:

[1803.01876] Edge states and topological invariants of non-Hermitian systems [1804.04672] Non-Hermitian Chern bands 先放着,以后可能会添加内容

 论文1月7日被接收. Science一作 经历了rebuttal之后漫长的等待,圣诞假期熬夜修改在凌晨把revision投出去.虽然在12月初就知道应该会被接收了,收到正式邮件的那一刻还是激动的.晕晕乎乎了一周多,才开始理智回归. 下面答题: 选题:这个由不得我定,我当初唯一的想法就是一定要跟个有真才实学的导师,不管什么课题,一定要跟着这个人.Erasmus Mundus的硕士项目第四学期做毕设,直接跑来跟了老板.因为我知道这个人无论是知识储备还是科研直觉还是聪明程度简直棒呆,事实也证明从09年一直跪这个人跪到16年,没有一刻在科研上觉得失望过.硕士快结束的时候,他让我去参观了某大型微器件研究所,然后我就接下了这个做不出来的时候绝望一做出来就Science的课题. 设计和实验:实验设计上,其实更多的是对一个idea的精修细改,根据实验结果improvise下一个实验.初始的idea和写出来的论文里的idea都是看起来简单的一笔,但背后凝结的是5年来不断地在绝望中修修改改.我们的转折点是换合作方,换了愿意全套搭设备的合作方,所有的参数都可以自己掌握以后,一切都快了起来.14年初老板大概觉得还是需要多几年在这个课题上,招了个博士生打算专攻,没想到在14年11月人家正式开始之前我就做出来了,也是好险我就不是一作了.再一个转折是美国长期合作巨牛来访,专家就是专家,一张SEM照片就发现我做出来的材料有多方面潜在应用,这才算是定下要投Science. 投稿:这个没什么好说的,老板和巨牛投Science经验很足.论文写得一字都不多余,因为Science有字数要求,Supplementary Material就是各种给正文挤不进去的数据.主要重点在我们本行,又做了其他测试说明有其他潜在应用,这点对Science尤其重要. 修改:碰到对我们有bias的reviewer,所以争辩了很久.除了他/她,其他人建议很中肯,也不难,就是加几个图减几个图这样,整体结构不需要改,对我们做出来材料的意义也都很认可.巨牛跟editor谈过以后直接跟我们说改完就会接收,不用在意那个不友好的reviewer.

下面是感想

其实没有觉得怎样,这个课题从09年年底开始一直没有好结果,13年初草草毕业,因为必须要毕业.到14年下半年,突然一切就都豁然开朗了,我给了自己一个交代,总算觉得对得起那张博士文凭了. 发顶级杂志,运气很重要,巨牛级别,起码我们领域,NS非子刊也不是年年都有的.大牛导师也是必须的,首先眼界不一样,您的结果,他看到的价值和别人看不一样.我刚做出来那个下午,我还觉得失败了,这玩意儿怎么不好好呆着脱落下来了.结果老板激动得上蹿下跳的,我却花了1个多月才意识到他为什么这么激动.之后把我的样品给各路大牛巨牛参观的时候,大家也都是精神一振,我才信服.而且导师名字眼熟,rebuttal什么的也都容易些. 中间长时间没有结果的折磨,都写在另一个答案里了: 做研究长年没有进展是怎样一种体验? 

是谁这么恨我还是这么狠施一公老师,好好的回答被踩成这样了清华大学施一公老师写的,我们指导老师让我们看的,刚好看到这个题目我就随手运过来了(在国际学术期刊上发表科研文章,是科研工作者与同行交流/取得国际影响的必经之路.有些国内的科学家实验做得很漂亮,但常常苦恼于文章写作力不从心,成为国际交流的一大障碍.本文从笔者施一公的亲身体验出发,给博士生/博士后以及年轻的PI(课题组长)提供一个借鉴. 我大学时的同班同学都知道,那时我的英文不算好(英文四级考试仅为"良'),写作尤其糟糕.初到美国之时,对英语环境适应得很差,读一篇<生物化学杂志>(JBC)的论文要五六个小时,还常常不理解其中一些关键词句的意思,压力极大. 很幸运,1991年4月我在约翰霍普金斯大学(Johns Hopkins University)攻读博士学位时遇到了学兄和启蒙老师John Desjarlais.听了我的苦恼后,John告诉我,"每天花45分钟读<华盛顿邮报>,两年后您的写作能力会得心应手'.这条意见正合我意. 我原本就对新闻感兴趣.于是,我每天上午安排完第一批实验后,都会在10点左右花一个小时阅读<华盛顿邮报>,主要看A版(新闻版).刚开始,我一个小时只能读两三个短消息或一个长篇报道,中间还不得不经常查字典看生词.但不知不觉间,我的阅读能力明显提高.1992年老布什与克林顿竞选总统,我跟踪新闻,常常一个小时能读上几个版面的消息或四五个长篇报道,有时还把刚看到的新闻绘声绘色地讲给师兄师姐听. 阅读直接提升了我的英语写作能力.看完一些新闻后,我常常产生动笔写自己感想的冲动.1992年巴塞罗那奥运会,中国游泳队取得了四金五银的好成绩,美国主要媒体纷纷指责这是中国运动员服用违禁药物,但没有任何检测的证据,完全凭美国运动员的感觉.此事让我很气愤,我生平第一次给<华盛顿邮报>和<巴尔的摩太阳报>(The Baltimore Sun)各写了一封信,评论报道的不公平.没想到两天后,<巴尔的摩太阳报>居然原封不动地把我的信刊登在<读者来信>栏目.同事祝贺,我也洋洋得意.受到此事鼓励,我在此后三年多的日子里常常动笔,有些论文发表在报刊上(大部分投稿石沉大海),也曾代表中国留学生写信向校方争取过中国学生的利益.有时还有意外的惊喜.1995年的一天,一位朋友打电话告诉我:今天出版的<巴尔的摩太阳报>上有我的评论论文.我急匆匆赶到街头买来5份报纸,果然,在A版的倒数第二页,以15厘米×15厘米的篇幅发表了我一个多星期前寄给报社/本以为不会发表的一篇抨击吴宏达的论文.以上是我个人英语写作能力提升的一段过程.但是,科研文章不同于读者来信,有其专业特点甚至是固定格式. 1994年,我第一次完整地写科研文章,感觉很差.好不容易写完的论文,连我自己都不愿意读第二遍,勉强修改之后交给了老板Jeremy Berg.他拖了3周没看我的论文,我实在忍不住了去催他.上午9点,Jeremy告诉我:今天看.11点,我去他办公室催,秘书拦住我,说Jeremy正在办理重要事务,两点前不得打扰.我心中惴惴,不知Jeremy在干什么.下午一点半,Jeremy急匆匆过来找我,拿了一叠纸,"这是初稿,您看看怎样,我们可以试试<科学>'.我仔细一看,天啊!一共7页,4个多小时,Jeremy已经把论文的整体写完了,只是缺少方式(Method)和参考文献(references).让我郁闷的是,他根本没有用我的初稿. 其实,写论文贵在一气呵成.我也沿袭了Jeremy的风格.2006年10月,在我们处于劣势的激烈竞争中,有两个课题面临被"scoop'(取消)的危险,我曾经两次一晚上赶出一篇论文.第一次是10月15日,傍晚8点左右开始写,通宵工作,第二天早晨10点完成一篇按照<细胞>杂志格式的文章,包括摘要(abstract),引言(introduction),结论(results),讨论(discussion),仔细阅读一遍后于下午4点半完成网上投稿.这篇论文最终发表在12月份<自然>子刊<结构与分子生物学>上(电子版于11月10日发表).另一次是10月18日,傍晚6点开始写,通宵工作,第二天早晨8点完成,上午9点半完成投稿,最终发表在12月15日的<细胞>上.当然,能通宵完成一篇论文,还有一个重要前提,就是对研究领域非常熟悉,对论文整体的大概思路已经深思熟虑,所有的图表(Figures)都事先做好了.这些前期工作即使全身心投入也需要3~4天. 从1994年自己写第一篇科研文章的艰难,到现在写起来得心应手/驾轻就熟,我总结出如下经验. 1.要写好科研文章,必须先养成阅读英语论文的习惯,争取每天30~60分钟.刚开始可以选择以读英语报纸/英语新闻为主,逐渐转为读专业杂志.我会在近期专门写一篇论文介绍一套行之有效的增强读专业杂志能力的办法. 2.写科研文章,最重要的是逻辑.逻辑的形成来自于对实验数据的总体分析.必须先讨论出一套清晰的思路,然后按照思路来做图表(Figures),最后才能执笔. 3.具体写作时,先按照思路(即Figures)写一个以subheading(小标题)为主的框架,然后开始具体写作.第一稿,切忌追求每一句话的完美,更不要追求词语的华丽,而主要留心逻辑(logic flow),注意前后句的逻辑关系/相邻两段的逻辑关系.写作时,全力以赴,尽可能不受外界事情干扰(关闭手机/座机),争取在最短时间内拿出第一稿.还要注意:一句话不可太长. 4.学会照葫芦画瓢.没有人天生会写优秀的科研文章,都是从别人那里学来的.学习别人的论文要注意专业领域的不同,有些领域(包括我所在的结构生物学)有它内在的写作规律.科研论文里的一些话是定式,比如"To investigate the mechanism of……,we performed……'(为了探索……的机制,我们做了……),"These results support the former,but not the latter,hypothesis……'(这些结果支持了前面的观点,而不是后面的,假设……),"Despite recent progress,how……remains to be elucidated……'(尽管最近的进展,怎样阐明……)等等.用两次以后,就逐渐学会灵活运用了.在向别人学习时,切忌抄袭.在美国一些公司,连续7个英语单词在一起和别人的完全一样,原则上就被认为抄袭(plagiarism). 5.第一稿写完后,给自己不要超过一天的休息时间,开始修改第二稿.修改时,还是以逻辑为主,但对每一句话都要推敲一下,对abstract和正文中的关键语句要字斟句酌.学会用"Thesaurus'(同义词替换)以避免过多重复.第二稿的修改极为关键,再往后就不会大改了. 6.第二稿以后的修改,主要注重具体的字句,不会改变整体逻辑了.投稿前,一定要整体读一遍,对个别词句略作改动.记住:学术期刊一般不会因为具体的语法错误而拒绝一篇论文,但一定会因为逻辑混乱而拒绝一篇论文.这套方式行之有效,我对所有的学生和博士后都会如此教导. 我的第一个博士后是柴继杰,1999年加入我在普林斯顿大学的实验室.柴继杰当时的英语阅读和写作能力很差.我对他的第一个意见就是"每天花半小时读英语报纸'.难能可贵的是:他坚持下来了!经过几年的努力,2004年柴继杰已经能写出不错的项目经费申请书(grant proposal),2006年他的第一篇独立科研文章发表在<分子细胞>(Molecular Cell)上,随后相继在<自然>发表两篇文章,在其他一流学术期刊发表十多篇文章.他的写作能力开始成熟.发表文章是一件值得高兴的事情,但要明白:文章只是一个载体,是为了向同行们宣告您的科研发现,是科学领域交流的重要工具.所以,在科研文章写作时,一定要谨记于心的就是:用最简单的话表达最明白的意思,但一定要逻辑严谨!其实,中文和英语文章皆如此! 

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