艾德思：Science恶性眼内癌症的元凶基因

  

葡萄膜恶性黑色素瘤(maligment melanoma of uvea)是成年人中最多见的一种恶性眼内肿瘤,在国外其发病率占眼内肿瘤的首位,在国内则仅次于视网膜母细胞瘤,居眼内肿瘤的第二位.此瘤的恶性程度高,易经血流转移,在成年人中又是比较多见,在临床工作中易和许多眼底疾病相混淆.(海军总医院肿瘤诊疗中心康静波)

来自华盛顿大学医学院的研究人员利用外显子组测序方式,找到了一种致命性眼睛癌症的关键基因,这一研究成果可能作为未来治疗这种癌症的靶标,并且用于其它具有高度转移性的癌症的治疗靶标.这一研究成果公布在Science杂志上.

由于这种癌症转移程度很高,因此要找到关键的基因并不容易,之前的研究发现这种癌症涉及到调节蛋白降解的特别基因的缺陷,为了进一步分析葡萄膜恶性黑色素瘤,研究人员采用了外显子组测序方式,结果发现在研究人员分析的31个肿瘤样本中有26个(占84%)在一个叫做BAP1的基因中存在着失活性突变.

BAP1蛋白是在1998年作为一个乳腺癌易感性蛋白BRCA1的结合伙伴而被首次发现的.BAP1蛋白可从蛋白质上清除一种叫做泛素的化学加和物,而泛素常常会标记在那些要被毁掉的细胞蛋白上.这些结果发现,BAP1信号转导通路不但可作为葡萄膜黑色素瘤的一种治疗目标,而且它还有可能作为其它具有高度转移性的癌症的治疗目标.

外显子组是指全部外显子区域的集合,该区域包含合成蛋白质所需要的重要信息,涵盖了与个体表型相关的大部分功能性变异.外显子组序列捕获及第二代测序是一种新型的基因组分析技术.

与全基因组重测序相比,外显子组测序只需针对外显子区域的DNA即可,覆盖度更深/数据准确性更高,更加简便/经济/高效.可用于寻找复杂疾病如癌症/糖尿病/肥胖症的致病基因和易感基因等的研究.同时,基于大量的公共数据库提供的外显子数据,科学家们能够结合现有资源更好地解释研究结果.

目前许多科学家都利用这一方式找到了致病基因,比如美国国家心肺血液研究所就从4名弗里曼谢尔登综合征患者的DNA中准确找出了致病基因变异.他们的研究表明,对于单个基因变异引起的疾病,外显子测序同样可以准确找到致病基因,与全基因组测序无异.研究人员认为,外显子测序也可用于多重基因变异引起的常见疾病,如糖尿病和癌症的研究中,来揭示该种疾病的致病基因.

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