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近日,Horticulture Research在线发表了大连理工大学生命科学与技术学院栾雨时教授课题组完成的题为"Tomato lncRNA23468 functions as a competing endogenous RNA to modulate NBS-LRR genesby decoying miR482b in the tomato- Phytophthora infestans interaction'的文章.该成果是在国家自然科学基金的资助下,他们长期致力于番茄抗病相关非编码RNA的研究,发表二十余篇miRNA(Horticulture Research, 2018, 5:9; Plant Cell and Environment, 2018, doi: 等)及多篇lncRNA(The Plant Journal, 2017, 89: 577-589; The Plant Journal, 2018, doi: 等)文章的基础上,将miRNA与lncRNA协同调控的作用综合研究的产物.该文不仅有利于加深人们对番茄抗晚疫病机制的理解,还可为其他植物非编码RNA的研究提供参考.
miR482b负调控番茄的抗性,过表达它的植株易感晚疫病.叶片接种病原菌后,miR482b的表达量显著降低,但其作用机制尚不清楚.该文作者撰写了特定程序,从番茄RNA-Seq数据中鉴定出89个具有原始内源靶标模拟物(eTM)的lncRNA,可沉默46个miRNA.研究发现lncRNA23468/lncRNA01308和lncRNA13262均含有miR482b的保守eTM位点.当lncRNA23468在番茄中过表达时,miR482b及其靶基因NBS-LRR的表达分别出现显著的降低和升高,抗病性得以增强;而沉默lncRNA23468则导致miR482b的积累,NBS-LRR减少,抗病性下降.将lncRNA23468的eTM位点突变(mlncRNA23468)后,未造成miR482b/NBS-LRR及植株抗病性的显著改变.说明lncRNA作为eTM可调控miRNA,lncRNA23468-miR482b-NBS-LRR相互作用影响着番茄对晚疫病的抗性.
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