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在医学SCI中常见的图片大致可以分为几大类别,不同的图片适用软件有所不同。除软件之外,还有很多注意事项,漂亮不漂亮各有审美,但不可以踩坑。
【统计图】
大多可用Excel,专业点的Graphpad Prism、Origin也很受欢迎,编程爱好者则多用R。Graphpad能满足大多生物医学的统计要求,R则几乎没有解决不了的统计问题。
像柱状图,散点图、线图、生存曲线、流式图等等,从数据生成的图。期刊对此类Figure要求最严,每种类型的统计图都有非常多需要注意的细节。
这张就是典型的柱状图,各种元素也很齐全。
图片要点
编号:如果是有多张图片拼合在一起的话,每张图片要用字母A、B、C、D来进行编号。每张编号的图片都要有相应的图注说明。
标题:多张图片在一起时,除了编号之外,最好还能有个标题。这样比编号更直观,让读者不看图注也能大概明白图片内容。
纵轴:多是数值,要注意有时候必须注明单位。
横轴:内容是分组情况时应写清组名,内容是数字(比如时间)时,要注明单位。
误差线:表示标准差或标准误。
显著性符号:要在图注中说明各种符号所表示的含义,一般来说*/**/***分别代表P<0.05/P<0.01/P<0.001。除*外,常用的还有#、△等。
散点图
线图
生存曲线(这个的确Graphpad大法好)
流式图(可用FlowJo制作)
【照片】
照片也是一种常用的图片类型,能够对现实如实的反应,在临床研究中使用的更多。
图片要点
照片背景应选用与其反差较大的颜色,突出边缘。下方应放置米尺,做标尺用,来说明大小。
照片应遵照真实性原则,可以适当调整整体亮度、对比度等,但不能对局部进行PS调整。同时,可以用箭头指示病变部位。
X-ray、CT、PET-CT、MRI等造影照片是照片的另一大种类。此类照片最好保留电子版图片。如果只有胶片资料,则应尽量使用专业扫描仪提取电子相片。若条件不允许,也应摆正角度,用高分辨率的数码相机记录。
【切片染色图】
其实这也是照片的一个亚型,但作为很多疾病诊断的金标准,染色图成为了很多论文中的支持结论的重要依据。染色图通过不同的化学试剂+抗体的组合,可以定性反映微观结构的改变,蛋白表达的分布等等,还有更为精细的量化操作,所以独立出来。
图片要点
做染色图的时候要贴上比例尺,比例尺能够说明微观结构的尺寸及放大倍数,是重要参数。上图中虽然没有画出来,但在图注里有这么一句说明:
C) IHC analysis of ZFX protein expression in human clinical samples of normal tissues, atrophy, intestinal metaplasia, dysplasia and GC tissues (n = 30, respectively), original magnification: X 200.
还要注意三个“度”。拍照时,注意调节曝光度,曝光度过低会让画面整体灰暗,曝光过度则可能损失图片重要细节,且后期很难用软件矫正。调节饱和度,饱和度代表画面的“鲜艳”程度。调节平衡度,尽量保证空白区域为纯白色,未矫正白平衡的照片会整体偏蓝或偏黄。
荧光染色图
和切片染色类似,只不过用荧光素标记分子,非常漂亮的一种图,通常会展示同一视野下多种分子的表达情况,并在最后展示合并(Merge)后的图片,可用Image J制作。此类图片要注意标记每种颜色代表的分子。
【条带图】
以Western Blot最为多见,还有半定量PCR、SDS page、免疫共沉淀等。条带图上的重要的信息包括:条带代表的分子名称、条带分子量以及分组情况。
图片要点
条带左侧标记了分子名称;上方用划横线的方式将若干条带分组;也可以在右侧标记蛋白分子大小(建议标注单位kDa)。
将不同条带裁剪组合在一张图上时,要注意保留条带上下一定的空白区域(或加上明显的边框),如有杂带也应如实保留,否则可能遭到质疑。
可以在不损失细节的情况下调整条带整体的亮度、对比度,但绝不能对条带局部进行调整甚至涂改,也不能从中间挖去某个条带。 也不能出现一图多用的情况,尤其注意不要重复使用同一张内参的条带图,也不要对条带进行简单的水平或垂直翻转就再次使用,一般editor和reviewer对这一点非常敏感,涉及科研诚信,不能马虎。
前不久东京大学的渡边嘉典教授就是用这个姿势掉坑的啊,还有些小伙伴表示“大家不都这样么”,唉,你非要浪出天际我也没办法。
【示意图】
用于说明概念,总结生化过程、通路等,要求直观明确。
细胞作用示意图
这类图简单的可用PPT,精致的可用PS、AI。虽说后者可以搞得很复杂,但我们又不是专业搞设计的,会其中几个常用操作就行了。
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